heterogeneous clusters

GROMACS recipe for symmetric Intel® MPI using PME workloads

Objectives

This package (scripts with instructions) delivers a build and run environment for symmetric Intel® MPI runs. This file is actually the README of the package. Symmetric stands for employing a Xeon® executable and a Xeon Phi™ executable both running together exchanging MPI messages and collective data via Intel MPI.

  • Desarrolladores
  • Socios
  • Estudiantes
  • Linux*
  • Servidor
  • C/C++
  • Intermedio
  • Intel® Parallel Studio XE Cluster Edition
  • symmetric MPI
  • native MPI
  • cmake
  • heterogeneous clusters
  • Intel® Many Integrated Core (Intel® MIC) Architecture
  • Mensaje pasa a interfaz
  • OpenMP*
  • Académico
  • Computación con clústeres
  • Procesadores Intel® Core™
  • Arquitectura Intel® para muchos núcleos integrados
  • Optimización
  • Computación en paralelo
  • Migración
  • Subprocesos
  • 面向使用 PME 工作负载的对称英特尔® MPI 的 GROMACS 方案

    目标

    该文件包(脚本及其说明)提供了针对对称英特尔运行的构建和运行环境。 该文件实际上是自述 (README) 文件包。 对称指采用至强™ 可执行文件和至强融核™ 可执行文件,两者通过英特尔 MPI 同时运行以传输 MPI 消息和集体数据。

    已有的面向对称英特尔 MPI 的 GROMACS 方案是:https://software.intel.com/zh-cn/articles/gromacs-for-intel-xeon-phi-coprocessor 但该方案强调所谓的 RF 数据集,无法充分利用特定的 Particle Mesh Ewald (PME) 配置选项。

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  • Linux*
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  • C/C++
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  • Intel® Parallel Studio XE Cluster Edition
  • symmetric MPI
  • native MPI
  • cmake
  • heterogeneous clusters
  • Intel® Many Integrated Core (Intel® MIC) Architecture
  • Mensaje pasa a interfaz
  • OpenMP*
  • Académico
  • Computación con clústeres
  • Procesadores Intel® Core™
  • Arquitectura Intel® para muchos núcleos integrados
  • Optimización
  • Computación en paralelo
  • Migración
  • Subprocesos
  • Suscribirse a heterogeneous clusters